La alfa 1 antitripsina fecal es una glicoproteína que representa el 90% de la alfa 1 globulina, su función es inhibir enzimas proteolíticas como elastasa, colagenasa y tripsina. Es considerada un marcador natural de pérdida proteica en las heces y de inflamación de la mucosa gástrica. Niveles elevados de A1A en materia fecal son de utilidad en el diagnóstico de enteropatías con pérdida de proteínas y procesos que incrementan la permeabilidad de la mucosa intestinal. En pacientes con enteropatía alérgica sus cifras se elevan en forma directamente proporcional a la respuesta inmunológica.