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La mieloperoxidasa (MPO) es el antígeno p-ANCA más comúnmente reconocido. Es una proteína catiónica de 140 kDa que se encuentra predominantemente en los gránulos azurófilos de neutrófilos y monocitos. Los anticuerpos p-ANCA (anti-MPO) se encuentran en la mayoría (90%) de los pacientes con poliarteritis microscópica y otras vasculitis (70% en el síndrome de Churg Strauss y 20% de los pacientes con poliarteritis nodosa). El 10% de los pacientes con granulomatosis de Wegener tienen anti-MPO en lugar del anti-PR3 que es característico de esta enfermedad; ambos rara vez aparecen juntos. Los anti-MPO se encuentran en el 65% de los pacientes con glomerulonefritis creciente necrotizante idiopática o asociada a vasculitis. El 30-40% de los pacientes con síndrome de Goodpasture tienen anti-MPO junto con anti-GBM. Estos pacientes son generalmente mayores y tienen una enfermedad renal menos grave que aquellos con anti-GBM solo. Ocasionalmente, se pueden encontrar niveles bajos de anti-MPO en otras enfermedades (particularmente infecciones bacterianas crónicas, colitis, enfermedad hepática) en presencia de otros ANCA.
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